Мерзкий Планктон придумал новый дьявольский план по захвату мира и, как обычно, начал с лагуны Бикини. Единственный, кто может остановить тирана, это гроза медуз и ветеран мыльных битв — Губка Боб! Освободить город от захватчиков и вернуть лагуне Бикини свободу непобедимому герою помогут верные друзья и, конечно, смекалка. Игроков ждут пять различных миров, где им предстоит пройти немало занимательных мини-игр, решить множество забавных головоломок и, конечно, разобраться со злыми солдатами Планктона — роботами.